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News
- 19/04/2024 - Eucarpia General Congress - Early bird registration extended
- 19/04/2024 - Disponibile un assegno di ricerca presso il CNR-IBBA di Milano
- 19/04/2024 - Disponibile una posizione di postdoc presso il CNR-IBPM di Roma
- 19/04/2024 - XVII Congresso FISV
- 10/04/2024 - Corso SIGA teorico-pratico “New Genomic Techniques: CRISPR/Cas9 in tomato and wheat"
- 01/03/2024 - Contributo SIGA per l'iscrizione di dottorandi e giovani ricercatori al V Convegno AISSA#under40
- 05/02/2024 - Premio SIGA per la migliore pubblicazione su rivista scientifica internazionale
- 24/01/2023 - Fascination of Plants Day 2024
- 22/01/2024 - Lettera SIGA-SIBV al quotidiano "Domani"
- 18/12/2023 - Pubblicato il documento SIGA sullo stato e le prospettive della conservazione dell'agrobiodiversità in Italia
Rilasciato sul web un assemblaggio preliminare del genoma del pomodoro
Il dr. Giovanni Giuliano (ENEA - C.R. Casaccia) comunica che un assemblaggio preliminare del genoma del pomodoro è stato rilasciato sul sito http://solgenomics.net/tomato/. Comprende una funzione ftp per scaricare la sequenza e una funzione blast. Copre circa 794 delle 950 Mb proiettate per l'intero genoma, raggruppate in 7409 scaffolds. E' stata ottenuta assemblando reads 454 (22x) Sanger (4x), 400.000 BAC ends e 200.000 Fosmid ends. L'Italia ha contribuito con reads 454 (10x) e 100.000 Fosmid ends. Il sequenziamento continuerà fino a ottenere una sequenza di qualità comparabile a quella di Arabidopsis o del riso.
Questo è il secondo genoma di Solanacea rilasciato, dopo il genoma di patata (ceppo doppio monoploide di S. phureja) rilasciato il 15 di Settembre da un consorzio internazionale comprendente l'Italia (http://www.potatogenome.net) e anch'esso ottenuto prevalentemente con metodologie Next Generation. Questi due rilasci quasi contemporanei aprono la strada a studi di genomica comparativa nel genere Solanum.